研究成果

PLoS Pathogens— 朱勃/陈功友联合团队研究揭示植物病原原核细菌通过A-to-I的 RNA编辑适应环境变化的新机制

发布时间:2020-08-22 

国际著名学术期刊PLoS Pathogens于2020年8月21日在线发表了上海交通大学农业与生物学院朱勃/陈功友联合团队研究成果“A-to-I RNA editing in bacteria increases pathogenicity and tolerance against oxidative stress”,揭示了原核细菌通过A-to-I的 RNA编辑适应环境变化的新机制。

 

 

腺苷-肌苷(A-to-I) RNA编辑是真核生物中重要的转录后事件,由ADAR家族的腺苷脱氨酶催化。由于肌苷(I)被聚合酶和翻译机制识别为鸟苷(G), mRNA编码区的A-to-I编辑可导致密码子改变,从而导致蛋白功能的多样性。而原核生物中A-to-I编辑及其生物学意义,还鲜有研究。研究团队通过自行开发的Python脚本对稻黄单胞菌稻生致病变种Xanthomonasoryzae pv. oryzicola (Xoc)在氧化应激下的A-to-I编辑事件进行识别和分析,发现A-to-I编辑在氧化应激胁迫下将鞭毛蛋白FliC第128位氨基酸由丝氨酸(S)变为脯氨酸(P),从而导致鞭毛丝结构的改变。这种转录后编辑可以通过增加生物膜的形成来增加氧化应激耐受性和和在水稻上的毒性。原核细菌恶臭假单胞菌Pseudomonas putida也存在A-to-I编辑响应氧化应激的机制。

 

 

上海交通大学农业与生物学院博士研究生聂文翰王赛以及中国科学技术大学博士后何瑞为论文的共同第一作者,上海交通大学长聘教轨副教授朱勃和长聘教授陈功友为论文的共同通讯作者。朱勃博士2017年以长聘教轨副教授引入交大农业与生物学院。该研究得到了科技部重点研发等项目(项目编号2017YFD0201108和2018YFD0201202)的资助。

论文链接:https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1008740

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